Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
H2AFVQ71UI9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H2AFVQ71UI9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2AFVQ71UI9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2AFVQ71UI9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms