Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY3Q70JA7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHSY3Q70JA7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHSY3Q70JA7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHSY3Q70JA7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.5 ms