Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFPL4BQ6ZWI9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL4BQ6ZWI9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFPL4BQ6ZWI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms