Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47EQ6ZV65 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM47EQ6ZV65 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM47EQ6ZV65 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms