Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCNT7Q6ZNI0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNT7Q6ZNI0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNT7Q6ZNI0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNT7Q6ZNI0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCNT7Q6ZNI0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms