Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY4Q6ZNE9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY4Q6ZNE9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY4Q6ZNE9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUFY4Q6ZNE9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY4Q6ZNE9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms