Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCNI2Q6ZMN8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCNI2Q6ZMN8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNI2Q6ZMN8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNI2Q6ZMN8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms