Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA5Q6ZMJ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA5Q6ZMJ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA5Q6ZMJ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARA5Q6ZMJ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARA5Q6ZMJ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARA5Q6ZMJ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA5Q6ZMJ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA5Q6ZMJ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARA5Q6ZMJ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCARA5Q6ZMJ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCARA5Q6ZMJ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms