Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00114Q6XXX2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00114Q6XXX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00114Q6XXX2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00114Q6XXX2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00114Q6XXX2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00114Q6XXX2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00114Q6XXX2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00114Q6XXX2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms