Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM4Q6P4Q7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM4Q6P4Q7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM4Q6P4Q7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM4Q6P4Q7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms