Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RGMBQ6NW40 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGMBQ6NW40 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGMBQ6NW40 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RGMBQ6NW40 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RGMBQ6NW40 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGMBQ6NW40 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGMBQ6NW40 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGMBQ6NW40 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGMBQ6NW40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGMBQ6NW40 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGMBQ6NW40 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGMBQ6NW40 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGMBQ6NW40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms