Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT80Q6KB66 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT80Q6KB66 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT80Q6KB66 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT80Q6KB66 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT80Q6KB66 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT80Q6KB66 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT80Q6KB66 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT80Q6KB66 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT80Q6KB66 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT80Q6KB66 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms