Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRHL2Q6ISB3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRHL2Q6ISB3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRHL2Q6ISB3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms