Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM68Q6AZZ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM68Q6AZZ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM68Q6AZZ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms