Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNDC8Q6A555 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TXNDC8Q6A555 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TXNDC8Q6A555 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TXNDC8Q6A555 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms