Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
VIRMAQ69YN4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
VIRMAQ69YN4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VIRMAQ69YN4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
VIRMAQ69YN4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
VIRMAQ69YN4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms