Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf135Q5VTT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf135Q5VTT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms