Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC38Q5VT99 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC38Q5VT99 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC38Q5VT99 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC38Q5VT99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms