Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RPRD2Q5VT52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RPRD2Q5VT52 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RPRD2Q5VT52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RPRD2Q5VT52 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
RPRD2Q5VT52 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms