Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNT1Q5JUK3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNT1Q5JUK3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNT1Q5JUK3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNT1Q5JUK3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms