Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9E4

SLC25A53, Solute carrier family 25 member 53, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A53Q5H9E4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A53Q5H9E4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A53Q5H9E4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A53Q5H9E4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC25A53Q5H9E4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms