Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWA3BQ502W6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWA3BQ502W6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWA3BQ502W6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VWA3BQ502W6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA3BQ502W6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.6 ms