Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MINDY4Q4G0A6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MINDY4Q4G0A6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MINDY4Q4G0A6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MINDY4Q4G0A6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MINDY4Q4G0A6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MINDY4Q4G0A6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms