Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF3L2Q3SX64 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF3L2Q3SX64 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF3L2Q3SX64 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF3L2Q3SX64 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF3L2Q3SX64 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF3L2Q3SX64 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF3L2Q3SX64 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF3L2Q3SX64 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ODF3L2Q3SX64 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ODF3L2Q3SX64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms