Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V0

MS4A18, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 18, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A18Q3C1V0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A18Q3C1V0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A18Q3C1V0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A18Q3C1V0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A18Q3C1V0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms