Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UVSSAQ2YD98 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UVSSAQ2YD98 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UVSSAQ2YD98 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms