Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM249Q2WGJ8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM249Q2WGJ8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMEM249Q2WGJ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM249Q2WGJ8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM249Q2WGJ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms