Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC6LQ2NKX8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ERCC6LQ2NKX8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERCC6LQ2NKX8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6LQ2NKX8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC6LQ2NKX8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.4 ms