Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPRED3Q2MJR0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPRED3Q2MJR0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPRED3Q2MJR0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms