Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPROQ16827 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPROQ16827 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPROQ16827 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPROQ16827 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPROQ16827 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPROQ16827 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPROQ16827 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPROQ16827 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPROQ16827 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPROQ16827 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
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PTPROQ16827 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPROQ16827 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPROQ16827 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPROQ16827 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPROQ16827 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPROQ16827 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
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PTPROQ16827 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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PTPROQ16827 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPROQ16827 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPROQ16827 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
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