Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3AQ16821 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP1R3AQ16821 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3AQ16821 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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