Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAPC1Q16533 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAPC1Q16533 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC1Q16533 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAPC1Q16533 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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