Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
DDB1Q16531 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDB1Q16531 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
DDB1Q16531 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DDB1Q16531 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
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