Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VPS72Q15906 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VPS72Q15906 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS72Q15906 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
VPS72Q15906 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
VPS72Q15906 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VPS72Q15906 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.82■■■■□ 3
VPS72Q15906 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.82■■■■□ 3
VPS72Q15906 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.81■■■■□ 3
VPS72Q15906 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
VPS72Q15906 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms