Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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TWIST1Q15672 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWIST1Q15672 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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TWIST1Q15672 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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TWIST1Q15672 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWIST1Q15672 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWIST1Q15672 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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