Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3R2Q15599 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3R2Q15599 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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