Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKIV2LQ15477 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIV2LQ15477 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SKIV2LQ15477 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms