Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A2Q15428 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3A2Q15428 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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