Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBE3CQ15386 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBE3CQ15386 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
UBE3CQ15386 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UBE3CQ15386 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBE3CQ15386 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms