Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX17Q15036 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX17Q15036 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX17Q15036 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX17Q15036 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms