Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SHPRHQ149N8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SHPRHQ149N8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHPRHQ149N8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHPRHQ149N8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHPRHQ149N8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
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