Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB39AQ14964 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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RAB39AQ14964 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB39AQ14964 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB39AQ14964 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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