Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GINS1Q14691 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GINS1Q14691 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GINS1Q14691 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GINS1Q14691 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms