Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDC1Q14676 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDC1Q14676 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDC1Q14676 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MDC1Q14676 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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