Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NID2Q14112 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NID2Q14112 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NID2Q14112 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NID2Q14112 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NID2Q14112 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NID2Q14112 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NID2Q14112 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NID2Q14112 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NID2Q14112 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NID2Q14112 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NID2Q14112 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NID2Q14112 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NID2Q14112 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NID2Q14112 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NID2Q14112 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NID2Q14112 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NID2Q14112 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NID2Q14112 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NID2Q14112 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NID2Q14112 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NID2Q14112 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NID2Q14112 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NID2Q14112 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NID2Q14112 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NID2Q14112 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NID2Q14112 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NID2Q14112 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NID2Q14112 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NID2Q14112 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NID2Q14112 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NID2Q14112 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NID2Q14112 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NID2Q14112 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NID2Q14112 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NID2Q14112 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NID2Q14112 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NID2Q14112 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NID2Q14112 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
NID2Q14112 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NID2Q14112 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NID2Q14112 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NID2Q14112 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NID2Q14112 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NID2Q14112 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NID2Q14112 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NID2Q14112 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NID2Q14112 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NID2Q14112 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NID2Q14112 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NID2Q14112 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NID2Q14112 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NID2Q14112 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NID2Q14112 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NID2Q14112 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NID2Q14112 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NID2Q14112 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NID2Q14112 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NID2Q14112 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NID2Q14112 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NID2Q14112 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NID2Q14112 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NID2Q14112 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NID2Q14112 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NID2Q14112 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NID2Q14112 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NID2Q14112 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NID2Q14112 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NID2Q14112 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NID2Q14112 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NID2Q14112 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NID2Q14112 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NID2Q14112 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NID2Q14112 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NID2Q14112 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NID2Q14112 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NID2Q14112 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NID2Q14112 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NID2Q14112 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NID2Q14112 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NID2Q14112 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NID2Q14112 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NID2Q14112 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NID2Q14112 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NID2Q14112 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NID2Q14112 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NID2Q14112 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NID2Q14112 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NID2Q14112 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NID2Q14112 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NID2Q14112 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms