Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF9Q13886 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLF9Q13886 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLF9Q13886 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLF9Q13886 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
KLF9Q13886 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF9Q13886 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF9Q13886 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF9Q13886 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF9Q13886 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF9Q13886 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF9Q13886 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF9Q13886 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF9Q13886 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF9Q13886 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF9Q13886 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF9Q13886 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF9Q13886 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF9Q13886 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF9Q13886 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF9Q13886 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF9Q13886 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF9Q13886 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF9Q13886 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF9Q13886 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF9Q13886 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF9Q13886 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF9Q13886 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF9Q13886 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF9Q13886 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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