Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX39BQ13838 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX39BQ13838 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX39BQ13838 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX39BQ13838 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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