Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB31Q13636 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB31Q13636 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB31Q13636 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms