Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPK1Q13546 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIPK1Q13546 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIPK1Q13546 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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