Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LSAMPQ13449 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSAMPQ13449 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSAMPQ13449 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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